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A few sequences were very difficult to align, and their alignment is considered unreliable. These sequence are inducated by the (U.) after the name. Some sequences differ from their EMBL counterparts. Changes to a sequence were only made when there was a serious doubt about the correctness of the EMBL entry (mostly the annotation), and are indicated in the entries.
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 Archaea (590) up

  •  Crenarchaeota (80)
  •  Euryarchaeota (377)
  •  Korarchaeota (4)
  •  environmental samples (129)

 Bacteria (12107) up

  •  Aquificales (26)
  •  Chlamydiales (107)
  •  Cyanobacteria (315)
  •  Firmicutes (4680)
  •  Fusobacteria (38)
  •  Nanobacterium (2)
  •  Planctomycetales (97)
  •  Proteobacteria (5097)
  •  Spirochaetales (348)
  •  Thermotogales (26)
  •  Verrucomicrobia (21)
  •  CFB group (420)
  •  Chrysiogenes group (1)
  •  Coprothermobacter group (2)
  •  Fibrobacter/Acidobacteria group (31)
  •  Flexistipes group (10)
  •  Green non-sulfur bacteria (43)
  •  Green sulfur bacteria (29)
  •  Nitrospira group (34)
  •  SAR406 cluster (2)
  •  Synergistes group (1)
  •  Thermodesulfobacterium group (5)
  •  Thermus/Deinococcus group (55)
  •  environmental samples (582)

 Eukaryota (6590) up

  •  Acanthamoebidae (59)
  •  Acantharea (6)
  •  Alveolata (475)
  •  Ancyromonadidae (1)
  •  Anurofeca (1)
  •  Apusomonas (1)
  •  Cercozoa (39)
  •  Choanoflagellida (7)
  •  Corallochytrium (1)
  •  Cryptophyta (42)
  •  Diplomonadida (22)
  •  Entamoebidae (6)
  •  Euglenozoa (152)
  •  Fungi (1553)
  •  Glaucocystophyceae (6)
  •  Granuloreticulosea (3)
  •  Haptophyceae (57)
  •  Heterolobosea (8)
  •  Lobosea (6)
  •  Mastigamoeba (1)
  •  Mesomycetozoa (8)
  •  Metazoa (1766)
  •  Microsporidia (105)
  •  Mycetozoa (4)
  •  Parabasalidea (89)
  •  Plasmodiophorida (2)
  •  Polycystinea (10)
  •  Psorospermium (1)
  •  Rhodophyta (332)
  •  Sphaerosoma (1)
  •  Viridiplantae (1526)
  •  stramenopiles (271)
  •  environmental samples (22)

 Mitochondrion (1039) up

  •  Acanthamoebidae (2)
  •  Alveolata (6)
  •  Cercozoa (1)
  •  Euglenozoa (9)
  •  Fungi (52)
  •  Metazoa (909)
  •  Mycetozoa (4)
  •  Rhodophyta (4)
  •  Viridiplantae (47)
  •  stramenopiles (1)
  •  Dictyoglomus group (3)
  •  core jakobids (1)

 Plastid (134) up

  •  Alveolata (4)
  •  Cercozoa (3)
  •  Cryptophyta (4)
  •  Euglenozoa (7)
  •  Glaucocystophyceae (6)
  •  Haptophyceae (5)
  •  Rhodophyta (5)
  •  Viridiplantae (88)
  •  stramenopiles (5)
  •  environmental samples (7)

Document last updated: Tue Jul 15 11:59:43 MEST 2003